Por comodidad casi siempre dejo los comentarios nativos de WordPress. Últimamente veo mucho el sistema Disqus implementado en blogs e incluso en periódicos. ¿Cuales usáis vosotros??

Disqus está muy bien pero yo prefiero el sistema de comentarios nativo ya que se tiene el control total e indexa los contenidos.
También probé Comments Evolved que es un plugin que integra los comentarios nativos. facebook, G+ y Disqus pero daba muy mal rendimeinto al blog.

Tambien me voy por los nativos sin duda alguna,solo que si tuvieras demasiados comentarios

Yo uso la caja de comentarios nativa, la caja de comentarios de Disqus como que no me agrada mucho se me hace que se ve un poco menos profesional pero es a decisión de cada quien, incluso con la caja de comentarios de google ganas un poco mas porque te ayuda al posicionamiento

Wordpress y Disqus

A mi el que más me gusta para proyectos serios es wpDiscuz - supercharged native comments. Si no me apaño bien con Disquss, que no da trabajo ninguno.

Nativo es mejor.

uso disqus, me gusta mucho esa plataforma y la tengo muy bien optimizada

En los 2 blogs que tengo utilizo los comentarios de Worpress amigo.