Cada categoría principal sería un blog independiente, aunque todos colgarían de un mismo dominio y sería una única instalación de WordPress. Dentro de cada blog, podríamos tener las categorías que necesitáramos y a la hora de enlazar o utilizar plugins de artículos similares sólo podrían poner los del blog en cuestión, por lo que los otros silos no se enlazarían.
Lo más complejo para montar algo así es crear una home. Esto funcionaria como otro blog más y habría que buscar la forma de hacer consultas a los diferentes blogs del multisite y llevar los contenidos (al menos los títulos y algún extracto) a la portada. Con un poco de código o CSS en caso de recurrir a algún plugin solucionado