Voy a comenzar una lista de las herramientas que suelo usar para trabajar, estaría bien que los demás os animarais a compartir cuales son vuestras herramientas online preferidas.

SEO
http://openlinkprofiler.org/ (para comprobar los backlinks, es el mejor que conozco que es gratis, la pega que tiene es que no puedes analizar los backlinks de una cierta URL, tiene que ser de un dominio o subdominio)
http://www.semrush.com/es/informer.html (el informer de semrush es gratis y te puede ayudar si cierto dominio ha sido tocado por G, viendo como su gráfica historíca de posiciones de SERP ha bajado)

EDICIÓN
http://www.bing.com/translator/ (para generar contenido desde otros contenidos que han desaparecido del mapa en inglés)
http://apps.pixlr.com/editor/ (descubierta ayer pero me parece alucinante lo que han logrado es tener un verdadero "photoshop" online)

EXTENSIONES NAVEGADOR
iMacros (para ejecutar los bots que tengo preparados)
Hola.org (VPN de navegador gratuito, no va super fino pero va)
Awesome Screenshot (para hacer capturas de pantalla de una web, va de lujo)


¿Cuales añadirías?

Añado algunas. Y propongo organizarlo por áreas para mayor comodidad

SEO
- http://www.ahrefs.com: Más que conocida para análisis de backlinks. Mejor con suscripción, pero con la versión gratis se puede hacer algo.
- http://webmeup.com/: Otra para analizar backlinks. Bastante información gratis.

EDICIÓN
- http://textmechanic.com: Muchas utilidades para tratar texto.

ORGANIZACIÓN
- http://www.evernote.com: Para organización de tareas, listas, etc.
- http://keep.google.com: Parecido pero más simple. Para notas rápidas, listas, etc. Sincronizado con el móvil Android.
- http://drive.google.com: Quién no la conoce?

EXTENSIONES CHROME
- SEOQuake
- MozBar


Iré añadiendo según recuerde más...

@javib me gusta la idea, acabo de actualizar mi mensaje poniendo las herramientas por áreas

WPO:
GTmetrix
webpagetest
pingdom

Segun se me ocurran más secciones iré añadiendo

Para checkear diferentes metricas y en bulk, como DA y PV, CF y TF....
http://websiteseochecker.com/

Uno que poca gente conoce y para mi es básico: Netpeak Checker.
http://netpeak.us/software/netpeak-checker/

Programa gratuito de desktop. Analiza todos los dominios que le pongas con un montón de métricas: DA, PA, PR, Enlaces entrantes, Salientes.... lo coge todo de distintas herramientas como Opensite, semrush, ahref, alexa etc etc.

Muy recomendable de tirarlo con varios proxys y desde un VPN, pero durante tiempo yo lo usé en mi ordenador a pelo y tiraba bien.

Si necesitas saber lo que contiene un sitio web hecho en wordpress, plugins, plantillas etc.

http://builtwith.com/

Banco de imágenes gratuitas para descargar.

http://pixabay.com/