Tengo 2 dominios de la misma temática dentro del mismo webmaster tools y el mismo hosting.
Dominio A.- Es un proyecto que ya tengo funcionando al 100% y está rankeando muy bien, está centrado en la Comunidad de Madrid.
Domino B.- Lo tengo totalmente parado, tengo una plantilla de webempresa sin hacer nada todavia, pero quiero hacer lo mismo que tengo en el otro con la diferencia que este es a nivel nacional.
La gran duda: ¿Puedo atacar a las mismas palabras clave en los dos?
¿o Google se va a mosquear? Es inevitable que ataque a las mismas palabras clave.

No debería haber problema siempre y cuando los textos sean distintos, si hay un alto grado de coincidencia.....

Buenas,

No creo que te de ningún problema, mientras no enlaces los blogs entre ellos, que eso si le pueden parecer "enlaces sospechosos" tipo pbn o enlaces recíprocos.